Вирус Arabis mosaic virus
Краткое описание вируса Arabis mosaic virus
Класс: IV ((+)ssRNA)
Подкласс: Picornavirales
Семейство: Secoviridae
Подсемейство: Comovirinae
Род: Nepovirus
Arabis mosaic virus[1]
 |
Листья, поражённые арабским мозаичным вирусом. |
Арабский мозаичный вирус является патогенным вирусом растений. Хозяевами могут быть: вишня, бересклет, форсития, сирень, персик, слива, малина, роза, клубника.
Вирус может вызвать пятнистость на листьях и деформировать лист. Зараженные растения могут иметь укороченные междоузлия. Симптомы схожи с таковыми у вируса пальчатых листьев виноградной лозы(Grapevine Fanleaf Virus), так что часто могут встречаться растения, заражённые ими обоими. Инфекция также часто может быть бессимптомной и проявление активности вируса зависит от типа корневой системы, сорта растения, и условий окружающей среды. Может вызвать потери до половины урожая.
Вирус распространён в Европе, и часто встречается на виноградных лозах в других государствах. Передают этот вирус от больных растений к здоровым кинжальные нематоды. Основной метод распространения - сквозное движение инфецированного материала воспроизведения[1][2].
Основные параметры генома вируса Arabis mosaic virus
В таблице 1 можно увидеть некоторые характеристики генома Arabis mosaic virus
| Таблица 1: "Характеристики генома Arabis mosaic virus" |
| Параметр |
Значение |
| Латинское название вируса |
Arabis mosaic virus |
| Русское название вируса |
Арабский мозаичный вирус |
| Количество фрагментов в полном геноме |
2 |
| Общая длина генома (п.н.) |
11154 |
| Количество кодируемых в геноме белков |
2 |
Вот последовательность одного из белков, кодируемых геномом вируса Arabis mosaic virus
>YP_053924.1 polyprotein P2
MAKFYYSDRRLACWAAGKNPHLGGSIESWLAAIKSDSSFRQTVKEDVQVNRLQPTAVRM
FSWKVGSGPIDNPEKCNWHYVLTGEVPAQPTEPVKAREVVVPPVKVIPSPPPVPRPYFR
PVGAFAPTRSGFIRATVERLSRKREESRAAALFAELPLEYPQGAPLVVPRGFAAMRWTY
HATWRRWYDASDERALRVHPGGPALPPPPPPPPIQKPPSFEERLQAALERQSCARAFAL
ETSLGLNMAWLGTAAIPSTSVCCADGRTTGGQTIAQEADPINHRVTSNTAPGRAQWISE
RRSALRRREQANSLQSLAAQTDMTFEQARNAYLGAADMVEQGLPLLPPLRNAYAPRGLW
RGPSTRANYTLDFRLNGIPTGQNTLEILYNPVADEEMDEYRDRGMSAVVIDALEIAINP
FGMPGNPTDLTVVATYGHERNMERAFIGSSSTFLGNGLARAIFFPGLQYSQEEPRRESI
IRLYVASTNATVDADSILAAISVGTLRQHIGSLHNRTVASSVHAAQVQGTTLRATMMGN
AVVVSPEGSLVTGTPEANVQIGSGSSMRMVGPLAWENVEEPGQTFTIRNRSRSMRVDRN
ADVGVALPRMSTTTRGLAGRGSVQVPKDCQAGRYLKTLDLRDMVSGFSGIQYEKWITAG
LVMPDFKVVIRYPANAFTGITWVMSFDAYNRITSSITTTASPAYTLSVPHWLLHHKNGT
TSCDIDYGELCGHAMWFNATTFESPKLHFTCLTGNNKELAADWEFVVELYAEFEAAKTF
LGRPNFVYSADAFNGSFKFLTIPPLEYDLSTTSAYKSVSLLLGQTLIDGTHKVYNYNNT
LLSYYLGIGGVVKGRVHICSPCTYGIVLRVVSEWNGVTNNWNQLFKYPGCYIGEDGNFE
IEIRSPYHRTPLRLLDAQAASAFTSTLNFYAISGPIAPSGETAKMPVVVQIDEIALPDL
SVPSFPNDYFLWVDFSAFTVDAEEYVIGSRFFDISSTTSTVHLGDNPFAHMIACHGLHH
GILDLKLMWDLEGEFGKSSGGVTITKLCGDKATGMDGASRVCALQNMGCETELYIGNFA
GANPNSALSLYSRWLAIKLDKARSMKMLRILCKPRGNFEFYGRTCFRV
|
Источники:
[1] Wikipedia
[2] entoweb.okstate.edu
|